90%以上男性病人的尿道分泌物作革兰氏染色涂片可迅速找到淋球菌，而女性阴道分泌物革兰氏染色检查的敏感性仅约60%。直肠受累时作直肠镜检查可见肠壁上有粘液脓性分泌物。所有的女性，以及尿道分泌物革兰氏染色检查阴性或结果可疑的男性，应作生殖道分泌物培养或遗传学鉴定。有咽或直肠感染症状的男性和女性，均应作培养或遗传学诊断，因为革兰氏染色的敏感性及特异性均较差。培养时，应将取自尿道，子宫颈，直肠和其他感染部位的渗出物接种到适宜的培养基(如改良的Thayer-Martin培养基)，在35~36℃温度，含有3%~10%CO2的大气中(可用蜡烛缸)孵育48小时。24小时后已可见某些菌落；大多数在48小时出现。若当时无足够的实验设施，可将标本接种到可输送的培养基上运送到实验室，在48小时内，最好在24小时内，作次代培养。

以基因探针为基础的能可靠而快速检测淋球菌RNA的诊断试验可结合检测衣原体的试验，以过筛淋球菌和衣原体所致的尿道炎或子宫颈炎。在此同时以及3个月后应作梅毒血清学试验(STS)，并且还应彻底检查病人以排除其他性传病。

淋病的诊断：必须根据接触史临床表现及实验室检查综合分析可确定诊断。

（一）接触史：患者有婚外性行为或嫖娼史配偶有感染史，与淋病患者（尤其家中淋病患者）共物史，新生儿母亲有淋病史。

（二）临床表现：淋病的主要症状有尿频尿急、尿痛、尿道口流脓或宫颈口阴道口有脓性分泌物等。或有淋菌性结膜炎、肠炎咽炎等表现，或有播散性淋病症状。

（三）实验室检查：男性急性淋病性尿道炎涂片检查有初步诊断意义对女性仅做参考，应进行培养，以证实淋球菌感染有条件的地方采用基因诊断方法确诊。