主条目：乙型肝炎疫苗

接种乙型肝炎疫苗是预防乙型肝炎的主要方法。随着乙肝疫苗的推广应用，中国乙肝病毒感染率逐年下降，5岁以下儿童的HBsAg携带率仅为0.96%。任何有条件的人，从新生儿（尤其是乙肝病毒携带者的后代）到成年人都应该注射乙肝疫苗。

按照现行的常规免疫接种程序，疫苗可分为三剂或四剂分期接种。在乙型肝炎母婴传播高发地区，应在出生后尽快（即在24小时之内）接种第一剂疫苗。95%以上的婴儿、儿童和青年接种全系列疫苗后体内产生的抗体可达到具有保护作用的水平。保护期至少持续20年，可能终身免疫。

以前未接种疫苗的所有儿童和18岁以下青少年均应接种疫苗。高危人群也应接种疫苗，其中包括：

1有高危性行为的人
2受感染者的伴侣和家人
3注射毒品者
4频频需要输血或血液制品的人
5实体器官移植接受者
6有感染乙型肝炎病毒职业风险的人，包括卫生保健人员
7前往乙型肝炎病毒高发生率国家旅行者。