居住于疟疾疫区或到过疫区的人都应预防，其室内外应用长效杀虫剂喷雾，纱门纱窗，床上用蚊帐，皮肤用驱蚊剂，应穿衣，特别在日落后，以保护皮肤免受蚊叮咬。

居留疟疾疫区期间应用药物预防。来疫区前一周就开始用药，停留期仍继续，离开疫区后一个月也要继续应用。氯喹为最常用的药，然而，世界上许多地区已有耐氯喹的恶性疟虫株。其他药物有甲氟喹和多西环素。但是，多西环素不能用于8岁以下儿童和孕妇。

没有绝对有效的预防药。在疫区的旅游者一旦发热，就应立即找医生检查。在找医生前，自服乙胺嘧啶-磺胺多辛（周效磺胺）复合药有效。