检查皮疹和溃疡来鉴别手足口病和其他原因所致的口腔溃疡，可将咽拭子或粪便标本送至实验室检测病毒，但病毒检测需要2-4周才能出结果。
1.血象 白细胞总数和中性粒细胞数大多正常。
2.病毒分离 采取病人的水泡液，唾液等以无菌处理后分别接种至：
①豚鼠脚掌皮内，4～5天后在其足趾间出现水泡;
②小鼠脑内及其乳鼠腹腔内而致死亡;
③猪肾，小牛肾细胞培养中出现细胞病变者，则可认为分离到口蹄疫病毒，可进一步用特异性血清鉴定其型别。
3.血清学试验 以补体试验结合最为敏感，起病后10～20天可获得阳性结果。