1.注意缺陷多动障碍 多动与抽动症的肌肉抽动完全不同，且伴有注意缺陷和冲动性，鉴别不难。

2.癫痫 某些类型的癫痫如颞叶癫痫可出现咂嘴等动作;肌阵挛性癫痫有局部肌肉抽搐发作的表现，但癫痫时往往呈发作性，而抽动症则抽动的现象较频繁。癫痫发作一般不受意志控制，而抽动症可用意志控制短暂的时间。癫痫多有意识障碍，脑电图有特殊改变，而抽动症无这种改变。

3.舞蹈病 此为风湿病变累及锥体外系所致，可有四肢和面部的不自主的无意识运动，除此之外，可有体温、血沉、C反应蛋白及ASO等的变化，发病前有链球菌的感染，这些有助于与抽动症的鉴别。