小儿肺炎易与支气管炎、急性粟粒型肺结核、干酪性肺炎、支气管异物、毛细支气管炎等疾病相混淆。
1、支气管炎：全身症状较轻，一般无呼吸困难及缺氧症状，肺部可闻及干罗音及中粗湿罗音，不固定，常随咳嗽或体位的改变而消失。
2、急性粟粒型肺结核：患儿发病急骤者常伴有高热，寒战，全身不适，气促，发绀等全身中毒症状，酷似支气管炎，但肺部往往无明显体征，或有细湿罗音，散布于两肺，多在吸气末发现，X线表现也与支气管肺炎有相似之处，根据结核接触史，临床症状，结核菌素试验阳性，血沉增快，痰或洗胃液检到结核菌及X线的追踪观察的特点即可鉴别。
3、干酪性肺炎：这种病变大多在虚弱或抵抗力低下的患儿中产生，X线显示在一个肺段以至一叶肺的大部显示致密的实变，轮廓较模糊，通常可见到较为透亮的液化区域，甚至透光的空洞，结合病史，结核菌素试验等，易与支气管肺炎鉴别。
4、支气管异物：有异物吸入史，或有呛咳史，临床轻，重不一，病程长短不等，病程迁延有继发感染者可反复发烧，咳嗽，肺部可闻及湿罗音与肺炎相似，有时听诊闻及气管拍击音可有助于诊断，但确诊靠纤维支气客镜检。
5、毛细支气管炎：与急性肺炎很相0似，但本病以喘憋为主，两肺可闻广泛的哮鸣音及细湿罗音，重病患儿缺氧明显，X线仅显示两肺透光度增强，膈肌下降，呈一过性肺气肿改变，少数病儿有少许斑点状阴影。