注意与宫内感染，中枢神经畸形，颅内出血等疾病鉴别。
1.新生儿颅内出血 CT检查可证实为颅内出血，可明确显示出血的类型，位置，形态，大小范围，出血量和对周围脑组织的压迫情况;而HIE病理变化包括脑水肿，脑组织坏死和颅内出血，这些病理改变可由临床表现及CT扫描证实。
2.头颅的先天畸形和病毒感染 若缺氧缺血发生在出生前几周或几个月时，患儿在出生时可无窒息，也无神经系统症状，但在数天或数周后出现亚急性或慢性脑病的表现，临床上较难与先天性脑畸形或宫内病毒感染相区别，CT检查可反映头颅的先天畸形，病原学和血清特异抗体检查有利于病毒感染性疾病的鉴别。