病原微生物感染（40%）：
许多病原微生物，如百日咳杆菌、结核杆菌等细菌及病毒、肺炎支原体、衣原体等引起的呼吸道感染，是儿童慢性咳嗽最常见的原因，多见于5岁以下的学龄前儿童。如果治疗不及时，细菌或病毒向下蔓延就会产生肺炎，咳嗽不断加重，并出现不同程度的发热，体质较差或病情较重的儿童有可能出现休克或死亡。这类咳嗽呈刺激性干咳，或伴少量白色黏痰，同时可能会有声音嘶哑等，治疗以抗感染为主。
气管异物（20%）：
气管异物是1~3岁儿慢性咳嗽要因这类咳嗽通常表现为阵发性剧烈呛咳，同时会有呼吸音减低、喘息、窒息史等表现，也可仅表现为慢性咳嗽伴阻塞性肺气肿或肺不张。睡觉时可用枕头把宝宝的后背和头撑起，防止分泌出的黏液滴落喉咙造成窒息。