由于囊肿可继发感染，故应争取手术治疗，以往多行囊肿切除手术，常有出血可能，如囊壁延伸至尿道附近，则手术操作困难，或不能取净囊壁，又有复发可能。严重疤痕者可致性交困难，故现在切除术仅应用于疑恶性病变者。囊肿造术（袋状缝合）经多年实践，确实方法简便、安全并发症少，复发率低，且可保持腺体功能。亦可应用于前庭大腺脓肿。

造口术适用于较大及反复急性发作的囊肿；切除术适用于伴感染性囊肿。较大囊肿选择最低点用co2激光聚焦（功率25w）切开皮肤0.5cm，或用nd∶yag激光光纤（功率20w）切开肿块最低点0.5cm。排除囊内物，对引流口进行每天清洁换药。手术后阴唇内侧会形成一个小口，囊肿复发时脓液会自动从造好的口中流出。