中药治疗妇科囊肿是根据月经周期、子宫内膜、卵巢的不同变化分以下四阶段用药：

一、月经期。此时因势利导，用活血调经法，以求行经通畅。

二、黄体期。此期阴阳并补，而以补肾阳为主。创造一个好的受孕环境，为孕卵着床准备条件。

三、卵泡期。以补血养阴为主，同时补肾阴的药物中加入补肾阳药。促使卵泡发育成熟。

四、排卵期。此时应在养精血的基础上加入通络、行气、活血的药物，以促发排卵。