1、肉眼检查；

2.染色检查。　

3.探针检查 用探针通过外口插入管道以明确瘘管的位置及内口所在此法一般在手术时麻醉下进行如操作不当或不熟悉此法可能造成假道形成。　

4.瘘管造影 自外口注入30%～40%碘油X线摄片可观察瘘管分布多用于高位复杂性肛瘘及蹄铁形肛瘘的诊断(图6)Yang(1993)检查临床疑有肛管直肠脓肿或瘘管17例6例临床上疑有脓肿肛管超声AUS检查也有脓肿表现;另外82%(9/11)AUS查出有瘘管而临床常规

5、纤维结肠镜检：对因克隆病、溃疡性结肠炎所致的瘘管，有诊断意义；检查未能发现。

6.肛管超声 对括约肌间瘘有时有确诊价值但无法确诊括约肌外瘘及经括约肌瘘。

7.MRI检查 Lunniss报道了35例此法检查结果与手术结果一致率分别为：原发性肛瘘(85.7%)继发瘘和脓肿(91.4%)蹄形瘘(64.3%)瘘内口80%从而认为MRI检查时确诊肛瘘位置有极高的准确性临床正确使用MRI不仅可以提高手术成功率而且可监测复杂性肛瘘是否完全愈合。

8.手术检查。切开瘘道，沿瘘道寻找内口，一般容易找到。