1.出血：偶尔因直肠孤立性溃疡可发生大出血。
2.肛门失禁：16%～20%的对气体失禁，17%～24%完全失禁，直肠脱垂引起失禁的原因包括：
①直肠脱垂产生实质性的直肠扩张，引起肛门内括约肌持续反射性抑制而松弛，尤其在老年人因耻骨直肠肌薄弱，活瓣不起主要作用时则一旦内括约肌功能障碍，就将引起失禁。
②分娩或长期用力排便使会阴异常下降，造成阴部神经被拉长的伸展性损伤，使盆底横纹肌去神经变性薄弱，肛管直肠测压有助于了解肛门括约肌等的功能，张连阳等对直肠内脱垂患者行肛管测压的结果表明其存在肛管压力的降低，其中直肠黏膜脱垂有肛管静息压降低，而全层直肠套叠则存在肛管静息压和咳嗽压的降低。