对PSC的诊断必须建立在对其临床特征，胆道阻塞的生化学指标，典型的胆道造影异常征象和肝脏组织学检查等，进行综合分析，方能作到诊断的准确无误，目前多数学者认为PSC诊断必须具备以下诸点：
(1)无胆管手术史。
(2)无胆总管结石病史。
(3)胆管壁增厚和硬化，并出现进行性梗阻性黄疸。
(4)长期随访排除胆管癌。
(5)无先天性胆管异常。
(6)无原发性胆汁性肝硬化。