选择治疗药物时主要注意以下几点：1)关节炎的种类、症状的特点；2)患者年龄、是否伴发其他疾病、是否并用其他药物、是否妊娠；3)药物的功效、耐受性、安全性、剂量、依从性；4)药物的价格及患者的承担能力。
类风湿关节炎的治疗药物主要包括非甾类抗炎药物(NSAIDs)、糖皮质激素(Gs)、改善病情慢作用抗风湿药物(DMARDs)、植物药、生物制剂等。非甾类抗炎药物为一线抗风湿药物，能迅速缓解关节症状，但不能阻止疾病进展，需酌情联用其他药物合用。Gs是最强的抗炎药物，如果正确使用，能迅速缓解患者炎症，控制病情，但不能滥用，适用于存在关节外表现、过渡治疗及局部应用。2010年中华风湿病学杂志类风湿关节炎治疗指南提出类风湿关节炎使用Gs的原则为短期、小剂量、联合维生素D3和钙剂、关节腔注射。对于类风湿关节炎患者，早期、联合、个体化方案使用DMARDs能早期控制病变，明显减缓病情进展，改善预后。此类药物主要包括甲氨蝶呤(MTX)、柳氮磺吡啶(SASP)、来氟米特(LEF)、硫酸羟氯喹(HCQ)等。但DMARDs对缓解疼痛的作用差，且起效需要一定时间，因此关节炎急性期应联合NSAIDs或Gs。A组B型溶血性链球菌感染可引起风湿热的关节炎表现，急性期使用青霉素是控制链球菌感染的最有效的药物，急性风湿热患者长期使用长效抗生素以预防远期风湿性心脏炎的发生，成人预防不得短于5年，儿童至少维持到18岁。结核性关节炎、真菌性关节炎需在积极有效抗结核或抗真菌药物的基础上结合上述治疗，但病毒性关节炎无需进行抗病毒治疗。反应性关节炎与微生物感染亦有关，但大多数患者的病程呈自限性，多在3-5个月消退，部分患者的病程长达1年，是否需要抗感染治疗，目前意见不一。植物药能辅助治疗关节炎，但目前尚无研究证实其在延缓骨破坏方面的确切疗效。生物制剂的出现是风湿病相关关节炎患者的福音，可显著改善患者预后。但使用之前需严格地筛查其适应症及禁忌症，权衡利弊。
强直性脊柱炎的治疗也以NSAIDs及DMARDs(SASP、MTX)为主，生物制剂尤其是肿瘤坏死因子(TNF)-α拮抗剂效果最佳，尤其对于对DMARDs反应不好的中轴关节受累患者。
骨关节炎的治疗除了对症止痛(对乙酰氨基酚、NSAIDs)外，还可在关节局部应用透明质酸。氨基葡萄糖类药物及双醋瑞因在骨关节炎的治疗中可以延缓疾病进展，建议长期应用。
痛风性关节炎的治疗包括急性期的抗炎止痛(NSAIDs首选)，及缓解期的降尿酸治疗。应根据患者肾功能情况、有无肾结石等选择具体用药。降尿酸药物主要包括抑制尿酸生成类(别嘌呤醇)及促进尿酸排泄类(苯溴马隆)。通常以后者为首选。