与其他部位急性骨髓炎相同，除应用有效广谱抗生素外，早期开窗引流，减低骨内压以防感染扩展。对病灶轻轻刮除，不可用力搔爬，否则会过多损伤骨松质，并形成较大骨腔，或使病灶扩大。跟骨为人体负重单元，故术后不宜过早活动，待新骨形成后方可负重行走。

跟骨骨髓炎之所以列为特殊部位或类型的骨髓炎分开单独讨论，是因它采用常规的足部切口及手术方法，疗法常不满意，足内侧或外侧切口仅用于软组织脓肿，或跟骨急性骨髓炎“开窗”引流。而在慢性跟骨骨髓炎应采用特殊的足跟跖面切口。通常在足跖面作切口是禁忌的，这是因为足底瘢痕可引起负重时疼痛，而采用Gaenslen切口显露，即在足底跟部确切的正中线作一纵行切口。起自第五跖骨基底水平，向后直至跟腱远端，纵行劈开跟骨，清除病灶。如此治疗跟骨难以治愈的跟骨慢性骨髓炎，不仅引流十分充分，治愈率高，而伤口愈合后，两侧皮瓣内翻，并形成跟垫，负重时没有疼痛。即便偶尔出现跟部跖面不平，通过垫鞋垫，一般不会影响走路。