慢性骨髓炎可能发生的并发症有以下几种：
(1)畸形：由于骨骺受炎症的刺激，使患肢过度生长而变长，或因骨骺板破坏，影响发育，结果肢体短缩，骨骺板一侧受破坏，发育不对称，使关节呈内翻或外翻畸形;由于软组织疤痕挛缩，也可引起屈曲畸形。
(2)关节强直：由于感染扩散到关节内，关节软骨面破坏，使关节呈纤维性或骨性强直。
(3)癌变： 窦道口皮肤由于不断受刺激，可合饼癌变，常见为鳞状上皮癌。