1.蹄疫反转录聚合酶链反应（RT-PCR），用于检测疑似感染动物水疱皮或水疱液中所有血清型口蹄疫病毒，适用于口蹄疫病毒的检测、诊断和流行病学调查。

原理：利用异硫氰酸胍方法提取RNA，在反转录酶的作用下，以RNA为模板，以引物为起点合成与RNA模板互补的cDNA链。利用西安天隆科技有限公司生产的DTC型基因扩增仪，在TaqDNA聚合酶的作用下，经高温变性、低温退火、中温延伸的循环，使特异性DNA片段的基因拷贝数放大一倍。经过35个循环，最终使基因放大数百万倍。将扩增产物进行电泳，经溴化乙锭染色后，在紫外灯照射下，肉眼可见DNA片段的扩增带。该方法可以检测所有亚型的口蹄疫病毒，检测结果为阳性，需进一步采用分型诊断试剂盒进行进一步检测。

2.血清学试验 ，ELISA是目前检测FMDV感染较为常用的诊断方法，其与补结试验、中和试验及间接血凝抑制、免疫扩散沉淀试验相比较、具有灵敏、快速、价廉等优点。