金葡萄感染应与猩红热鉴别：猩红热的发病与以往比较，病人数减少了，典型病例减少了，但不典型的病例增多了，其原因是链球菌本身的毒力并不很强，而且对青霉素至今仍然敏感，尚无耐药性，所以用青霉素治疗效果明显，有些孩子得了链球菌感染，竟然家长，甚至医生也没有诊断清楚，而用了抗生素治疗，虽然用的不一定是青霉素，其他抗生素对链球菌也有效果，这就是没有出现猩红热典型表现的病例。
葡萄球菌肺炎应与干酪性肺炎，革兰阴性杆菌肺炎，肺脓肿，肺癌鉴别，进一步检查：X线胸片，痰培养+药敏试验。