1、诊断类型在术前常难以准确确定。有些患者其阴茎弯曲非常严重，尿道开口仍可位于阴茎远端，患儿甚至可站立解尿，但一旦术中将纤维索带组织松解，尿道口即会退至阴茎近端。在充分矫正阴茎下弯后，再根据退缩后的尿道口的位置来确定类型。
2、确诊尿道下裂可能为某些严重泌尿生殖系畸形的表现，如两性畸形。比较严重的尿道下裂，畸形伴发率尤其高。应注意鉴别有无性别异常。外生殖器表现模棱两可的，尿道下裂伴隐睾的患者，首先进行染色体检查。若明确为男性的46XY，先行睾丸下降固定，同时进行性腺活检。若为睾丸，但发育差，加之阴茎发育很小的情况，与家属商讨后，考虑做成女性为好。