(1)慢性细菌性前列腺炎：也表现为尿频，尿急，尿痛伴尿道滴液，有下腹及会阴部疼痛，两者主要根据VB1，EPS，VB3的细菌培养进行鉴别，慢性细菌性前列腺炎VB1可有或没有细菌，EPS通常有细菌生长，VB3的细菌培养为阳性;而慢性非细菌性前列腺炎VB1，EPS，VB3的细菌培养均为阴性。
(2)慢性膀胱炎：也表现为尿频，尿急，尿痛伴下腹及会阴部疼痛，但慢性膀胱炎VB1，VB3的细菌培养为阳性，而EPS无细菌生长。
(3)慢性尿道炎：也表现为尿频，尿急，尿痛，VB1的细菌培养为阳性，而VB3，EPS的细菌培养无细菌生长。