对任何尿石患者的诊断都应包括：有没有结石，结石的数量，结石的部位，结石可能的成分，有无合并症及结石形成的原因，只有弄清了上述这些问题之后，才算得到了一个完整的诊断。
1.病史，由于尿石症是多因素的疾病，故应详细询问病史，应尽量详细地了解职业，饮食饮水习惯，服药史，既往有无排石的情况及有无痛风，原发性甲状旁腺功能亢进等病史，具体包括：
①饮食和液体摄入，如肉类，奶制品的摄入等；
②药物，主要了解服用可引起高钙尿，高草酸尿，高尿酸尿等代谢异常的药物；
③感染，尿路感染，特别是产生尿素酶的细菌的感染可导致磷酸镁铵结石的形成；
④活动情况，固定可导致骨质脱钙和高钙尿；
⑤全身疾病，原发性甲状旁腺功能亢进，肾小管酸中毒(RTA)，痛风，肉状瘤病等都可以引起尿石症；
⑥遗传，如肾小管酸中毒(RTA)，胱氨酸尿，吸收性高钙尿等都有家族史；
⑦解剖，先天性(肾盂输尿管交界处梗阻，马蹄肾)和后天性(前列腺增生症，尿道狭窄)的尿路梗阻都可以引起尿石症，髓质海绵肾是含钙结石患者中最常见的肾结构畸形；
⑧既往的手术史，肠管的切除手术可引起腹泻，并引起高草酸尿和低枸橼酸尿。
2.体征
一般情况下，肾结石患者没有明确的阳性体征，或仅有轻度的肾区叩击痛，肾绞痛发作时，患者躯体屈曲，腹肌紧张，脊肋角有压痛或叩痛，肾绞痛缓解后，也可有患侧脊肋角叩击痛，肾积水明显者在腹肌放松时可触及增大的肾脏。