睾丸疼痛的治疗应在确定其病因的基础上进行对症治疗，一时查不出原因，则可做镇静和止痛的对症治疗。必要时可采用精索普鲁卡因封闭治疗，这样可以阻断神经痛的痛源和大脑痛觉中枢之间的恶性循环。有些人稍有不适或根本没有不适也能诱发睾丸的疼痛，这时完全是精神作用在作怪。有些人则把疼痛与手淫联系起来，整天背着沉重的内疚的思想负担。殊不知过度焦虑、过分把注意力集中在性的表现能力上反而会造成精神性阳痿等性功能障碍。
传统治疗睾丸炎的方法是使用抗菌素、止痛类药以及手术引流，这些方法各有利弊：
一方面，抗菌素、止痛类药只能缓解暂时的疼痛，治标不治本，效果不能立竿见影，而且长久服用，会让致病菌产生耐药性，副作用也大。
另一方面，由于该病常与尿道炎、前列腺炎同时存在，而尿道炎和前列腺炎又是较为难以治疗的感染性疾病，这就直接增大了睾丸炎的治疗难度。特别是对那些慢性睾丸炎多次反复发作者，有时不得不做输精管结扎术或睾丸切除手术，给患者带来了巨大的伤害。