遗精的主要病机有二条，第一条为肾虚封藏不固，另一条为精室受扰。一个为虚证，另一个为实证或虚实夹杂证。遗精的病因尽管有先天禀赋不足，也有后天恣情纵欲、劳心过度、妄想不遂、湿热下注 (过食肥甘、饮酒过度)，但究其病机不外以上两条(两个方面)，造成封藏不固的原因以先天不足、禀赋素亏，或后天损伤过度，伤及元阴、元阳为主。

精室受扰而遗精，多为湿热痰火下注而遗泄，也有阴虚内热，虚火(相火)扰动精室者。随着人们生活条件的改善，一些人恣食膏粱厚味，以酒为浆，以妄为常，生活无规律，体形过于肥胖，湿热痰火由脾虚而内生，湿热、痰火沿三焦道而下注于膀胱、肾，扰动精室而遗泄。另外，杂念妄想不遂，或劳心过度，心火亢盛，心阴暗耗，心火不能下交于肾，肾水不能上济于心，水亏火旺，心肾不交，扰动精室而致遗泄。

由此看来，不论精关不固或精室受扰，均为遗精的主要病机。