女性感染HSV后，引起外阴炎、阴道炎，可能妨碍正常的性生活，减弱进入阴道的精子数量及影响其活动力。而子宫颈炎和子宫内膜炎，不利于精子穿透宫颈粘液上行;而子宫内病毒感染，病毒经胎盘传给胎儿，可致胎儿死亡或流产 。男性感染HSV后，引起前列腺炎而造成精液不液化，也可影响附性腺分泌物的生理功能，导致不育。

女性HSV感染与子宫颈癌有较密切的关系，也可经产道传给新生儿，引起新生儿口腔溃疡，角膜炎，甚至累及多器官而病死率非常高。