1、脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为神经精神方面的异常。神经异常的表现多有发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，重者则大脑、丘脑下部、底节、脑干、小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
2、精神异常表现为兴奋多语、烦躁、哭笑无常、失眠、行为异常、幻觉、幻想，或表情淡漠、缄默不语、活动减少、不吃、定向力差、记忆力减退、大小便失禁等。
3、伴随脑炎后遗症症状在脑炎发病之前或同时伴有相应病毒感染的症状。
4、前驱期患者有发热、头痛、肌痛、呕吐、腹泻等表现。