1、加强护理
病程中应加强护理，防止褥疮发生。要供给一定的水分、营养及电解质。对出现精神症状的病儿要防止发生意外。 观察是否出现脑疝的先兆。
2、抗病毒治疗
虽然目前尚无有效的抗病毒药物，但以下药物可以使用：碘甙(疱疹净)、三氮唑核苷(病毒唑)、丙种球蛋白，其他 如转移因子，干扰素可以提高机体对病毒的抵抗能力，均可应用。
3、对症处理
退热、止痉。高热可以引起抽痉。用物理降温或中、西药物退热。苯巴比妥或安定可预防或控制抽搐;减轻脑 水肿。20%甘露醇。亦可用氢化可的松或地塞米松。
4、手术治疗
由于脑炎后遗症患者体质的问题，手术治疗脑炎后遗症是一种冒险疗法，手术治疗不仅风险大、创伤大、疗效也不明显，所以手术治疗脑炎后遗症是不可取的。