慢性肾功能衰竭的病因，大致可分为三类：

1．局部病变。疾病主要侵犯肾脏，且以肾脏为主要表现，其中以慢性肾炎、慢性肾盂肾炎最为多见。

2．下泌尿系梗阻。主要表现为膀胱功能失调，容易继发感染而引起肾功能衰竭，如前列腺肥大等。

3．全身性疾病与中毒。如高血压、肾动脉硬化症、糖尿病及镇痛药或重金属中毒等。某院对30年来住院的8947名65岁以上老年病人进行统计分析，各种疾病的发病率进行排队，高血压病、糖尿病、肾盂肾炎、慢性肾炎分别占第1、10、25、31位，这些疾病均可导致慢性肾功能衰竭。

中医认为，肾功能衰竭是由各种疾病的不同病因发展到脾肾阳衰，阳不化湿，使水浊内生，浊邪壅塞三焦而产生。因此，脾阳亏损，肾阳衰微是肾功能衰竭之本，浊邪壅塞，三焦不行，导致心肺、脾胃、肝等脏腑受损是其标，病变部位则在肾。