早期常无明显症状，尿路造影也无异常，惟一重要的阳性发现只是尿内有少量红细胞和脓细胞，此时尿内可查到结核分枝杆菌，随着病情的发展，可出现下列症状：
1、膀胱刺激征
这是肾结核的典型症状，约80%病人尿频，从3～5次/d逐渐增多至10～20次/d，这是由于含有结核分枝杆菌的脓尿刺激膀胱黏膜或黏膜溃疡所致，晚期膀胱挛缩，容量很少，每天排尿次数可达数十次，甚至呈尿失禁现象，在尿失禁的同时有尿急，尿痛。
2、血尿
这是肾结核的另一重要症状，发生率约70%，一般与尿频，尿急，尿痛等症状同时出现，多为终末血尿，严重时有血块，是由于膀胱结核性炎症，溃疡在排尿时膀胱收缩所致出血，如在膀胱病变之前，肾脏结核出血，则表现为无痛性全程血尿。
3、脓尿
发生率约20%，尿液中有大量脓细胞，也可混有干酪样物质，严重者呈米汤样，也可为脓血尿。
4、腰痛
发生率约10%，早期一般无腰痛，但晚期结核性脓肾，可出现腰痛，如对侧肾积水，则可出现对侧腰痛，少数病人可因血块或脓块堵塞输尿管而引起肾绞痛。
5、全身症状
贫血，低热，盗汗，食欲减退，消瘦无力等，双侧肾结核或一侧肾结核，对侧肾积水，晚期可出现尿毒症，部分肾结核病人可有高血压，可能与肾小动脉狭窄导致肾素分泌增多有关。
一般认为，遇有下列情况应想到肾结核的可能：

①有慢性膀胱刺激症状即尿频，尿急，尿痛，而尿内又有蛋白和红，白细胞者。

②青年男性患者表现为慢性膀胱刺激症状。

③逐渐加重的尿频，尿急，尿痛或伴有血尿，经抗感染治疗无效者。

④尿液呈酸性，有脓细胞而普通培养无细菌生长者。

⑤有肺结核或其他肾外结核病灶，尿液出现少量蛋白，镜检有红细胞者。

⑥体检发现前列腺缩小，变硬，表面高低不平，附睾，精囊硬节或输精管增粗，阴囊有慢性窦道者。
以上为肾结核的常见表现，但有相当一部分不典型病例可能没有上述表现，例如在最近报道的1组349例肾结核患者中，约25%的患者无自觉症状或仅有上述1～2种极轻微表现，这类不典型病例往往从临床表现及一般化验检查中不易作出诊断，但却具有以下某种特征性表现：

①中青年患者反复出现无症状血尿。

②仅有轻微腰痛而无膀胱刺激症状，静脉肾盂造影(IVU)显示不明原因之一侧输尿管下端梗阻。

③无症状而偶然体检IVU显示一侧肾脏不显影。

④仅有顽固性尿频而无其他明确原因，上述表现对肾结核的诊断有很大帮助，然而尚需作进一步全面系统的检查，以确定诊断。