(一)心电图：心电轴右偏，不完全性或完全性右束支传导阻滞，P波高大，右心室肥大。第一孔房间隔缺损心电轴左偏，P-R间期延长，可有左心室高电压和左心室肥大。晚期出现心房纤颤。
(二)X线检查：主要表现为右心房增大，肺动脉段突出，主动脉结小，呈典型梨形心。肺充血透视下可见肺门舞蹈征。第一孔缺损可见左心室扩大，肺动脉血管增粗。
(三)超声心动图：可明确显示缺损位置、大小、心房水平分流的血流信号，右心房、右心室扩大。
(四)磁共振断层显像：横面磁共振断层显像可在不同水平显示出心房间隔的缺损。
(五)心脏导管检查和选择性指示剂稀释曲线测定：右心导管检查可发现从右心房开始至右心室和肺动脉的血氧含量均较上下腔静脉高1.9%容积以上，说明在心房水平有左至右分流存在。心导管可能通过缺损而由右心房进入左心房。此外，本检查还可了解肺动脉压力和阻力、分流量大小，发现器质性或功能性的肺动脉口狭窄。
选择性指示剂稀释曲线测定较血液氧含量测定更易于发现分流少的病人。其中以用氢作为指示剂由呼吸道吸入，用带铂电极的心导管在右心各腔记录稀释曲线提前到达，其到达时间短于4秒钟。
(六)选择性心血管造影：第一孔未闭型的病人，选择性左心室造影可观察到二尖瓣的返流。第二孔未闭型的病人则可能观察到二尖瓣脱垂。