伊波拉目前共发现4种品系。两种分别命名为EBO-Z（Ebola-Zaire，扎伊尔伊波拉）和EBO-S（Ebola-Sudan，苏丹伊波拉）在 1976年被确认。相对于扎伊尔伊波拉的90%的死亡率，在苏丹爆发的埃博拉病毒的死亡率较低，约为50%。1990年，相似的病毒在从菲律宾进口到美国维吉尼亚州雷斯顿的猴子中发现。这种病毒被命名为Ebola-Reston。