卫生部中日友好医院是由日本国政府提供无偿援助，中日两国政府合作建设的大型综合性现代化医院。1984年10月23日开院，直属中华人民共和国卫生部领导。医院位于北京市朝阳区和平里樱花东路，占地9.7公顷，目前建筑面积11万平方米，现编制床位1315张，设有53个临床、医技科室，附设中日友好临床医学研究所及培训中心。医院以疑难疾病、危急重症诊治为重点，以中西医结合为特色，融医疗、教学、科研、康复和预防保健等多项功能为一体，同时承担中央干部保健任务以及100多个国家、地区的涉外医疗任务。
    卫生部中日友好医院于1993年被评为国家三级甲等医院,并先后被评为北京市“十佳”医院和全国“百佳”医院。2001年被列为中央保健医院。同时是北京大学临床医学院和北京中医药大学临床医学院。医院现有副高级技术职称以上人员450余人，硕士研究生学历以上人员近400人。拥有螺旋扫描CT机、磁共振成像系统、血管造影X线机、医用直线加速器等性能先进的大型医疗设备。
    建院以来，承担了多项国家级、省部级科研课题，曾获国家级、省部级科技进步奖等多项奖励。医院的肾内科、神经内科、心脏内科、骨科、中医肿瘤科承担国家卫生部临床学科重点项目；中医肿瘤科还是国家中医药管理局重点学科；电化疗科的电化学疗法、中医肛肠科的“安氏疗法”是国家卫生部十年百项计划项目；骨科、中医风湿病科、电化疗科、检验科承担首都医学发展科研基金重点项目。
    建院以来，卫生部中日友好医院作为全国医疗行业对外交流的窗口，曾被外国人在京协会评为“外国人在京就医国有医院满意率第一单位”，并与日本、美国、法国、韩国等许多国家的大学、科研单位和医疗机构建立了良好的合作关系。
    卫生部中日友好医院是全国精神文明建设先进单位。2003年，被中共中央确定为全国保持共产党员先进性教育活动试点单位之一；同年，在抗击非典斗争中被指定为非典防治专病医院，在卫生部党组的直接领导和全院职工的共同努力下，出色地完成了任务。