舟山市妇幼保健院组建于1994年底；2009年5月12日，原舟山市人民医院、舟山市妇幼保健院、舟山市中医骨伤联合医院整合为舟山医院，医院又名舟山医院妇幼保健院区。

    医院占地面积1.2万平方米，总建筑面积2.97万平方米，是一所集医疗、保健、科教为一体的三级乙等专科医院，是全市100万人口的妇幼保健中心。医院在编职工562名，卫技人员509名，其中高中级职称300名。职业医师195名，注册护士240名。医院分临床、保健二大部分，设有10个病区、开放床位400张，开设专家专科门诊60多个。2009年门急诊65.18万人次，出院1. 30万人次，业务收入1.73亿元。医院拥有16排螺旋CT、数字胃肠机、中央胎心监护系统、腹腔镜、宫腔镜、汽化电切镜等十万元以上的大型仪器设备106台，为医疗、保健、科研提供了较好的工作条件。

    医院立足海岛，克服群众居住分散、交通不便，资源共享性差等困难，坚持走保健与临床互相促进共同发展之路，使舟山市妇幼卫生事业得以蓬勃发展。全市各项妇幼卫生工作质量指标始终位于省内先进行列，高危孕产妇管理、流动孕产妇管理、婚前保健、新生儿疾病筛查等工作在省内堪称示范，婴儿死亡率、五岁以下儿童死亡率持续走低。2007至2010年，创造了全市连续4年无孕产妇（包括流动孕产妇）死亡的优异成绩，2009年获得了卫生部妇社司和省卫生厅的专题表彰。2010年“大海中的平安舟”被评为“感动浙江卫生十大事例”之一。

    医院的妇、产、儿科医疗技术水平一直保持市内领先。市级、市局级重点学科有生殖内分泌、

    妇科微创、妇科肿瘤、围产医学、儿童呼吸、儿童消化等学科。医院本着为海岛群众带进先进技术、便捷服务的工作宗旨，坚持走技术创新之路，陆续设立了一些特色科室，有生殖医学中心、乳腺疾病防治中心、产前诊断中心、新生儿疾病筛查中心等。生殖医学中心建有舟山唯一的男性精子功能实验室，开展了人工受精辅助生育技术、试管婴儿、冻融胚胎移植技术等，该中心年平均收治不孕不育患者4000余人次，人工授精成功率达到20.5%。医院还开展亚健康体检、婴儿游泳、婴儿抚触等特色服务项目。

    医院及其科室先后获得全国杨崇瑞妇幼卫生基金奖、全国卫生系统先进集体、全国“三八”红旗集体、全国“明明白白看病”百姓放心医院、全国卫生系统“护理专业巾帼文明岗”、全国妇联颁发的“巾帼文明示范岗”、国家级爱婴医院、省产科质量优胜单位、省优生优育工作先进单位、省平安医院、省妇幼保健工作先进集体、市级文明单位、市重才爱才先进单位等荣誉称号。