安徽中医学院附属针灸医院(第二附属医院)成立于1985年，是全国最早成立的省级针灸专科医院。医院于1997年被省卫生厅评定为安徽省特色中医院，2005年被省卫生厅评定为“三级甲等”中医专科医院，2008年分别被国家中医药管理局授予“国家中医药国际合作基地”、世界针灸学会联合会授予全球首家“临床基地”，2009年被中国针灸学会授予“针灸标准化示范基地”。近年来，连续获得 “安徽省诚信医院”、“合肥市文明单位”等称号。

　　医院现占地19040 m2，建筑面积14100 m2。2008年11月，医院40000多m2综合楼建设已经报批立项，目前大楼设计和院内规划工作已经完成。医院编制床位数300张，现开设床位228张。全院职工248人，其中卫生技术人员190人，中医药人员占85%以上。现拥有高级专业技术职称人员50余人，其中有国家中医药管理局批准的全国名老中医学术经验继承导师5人，名老中医学术经验继承人15人;全国中医药优秀临床人才2人，安徽省“江淮名中医”培养对象10人。

　　医院坚持“大专科、小综合”的发展模式，在保证医院基本业务功能的基础上，重点发展针灸学科以彰显学科优势和打造品牌效应。医院坚持继承、创新的并重发展，在各科疾病的诊治中倡导“中医为先、针灸为主、西为中用”，大力促进医院的专科特色和学术发展。配备了一批诸如三维电脑推拿牵引床、电脑颈椎牵引器、基础康复器材、中药熏蒸床、熏灸器、全自动中药煎药包装机组、中药制剂设备、针灸诊断治疗仪等富有中医特色诊疗设备，为坚持中医疗法，突出中医特色提供了设备上的保障。

　　医院重视现代科学技术在临床诊疗和教学科研中的应用，拥有多排螺旋CT、大型X光机及CR、全自动生化分析仪、彩色及黑白超声诊断仪、五分类血球计数仪、电子胃镜、彩色多普勒脑超声仪等先进的医疗设备。